Après son Habilitation à diriger les recherches qui a donné lieu à la publication d’un ouvrage en 2020 sous le titre « Conjurer la dissension religieuse : la justice du roi face à la Réforme (1555-1563) », Sylvie Daubresse envisage de reprendre le dossier. Cette fois, il s’agira d’exploiter les éditions qui ont été faites de documents sur la Réforme depuis François I^er jusqu’en mars 1550 dans les archives du Parlement. Il resterait à dépouiller cinq années du règne d’Henri II pour faire le lien avec le début chronologique de l’HDR. Le but serait de publier un ouvrage de synthèse sur le complexe processus qui conduit à une terrible guerre entre catholiques et protestants.

Daubresse entreprend également d’établir l’index (noms, lieux) des huit volumes des lettres du roi Henri III pour la « Société de l’Histoire de France », dont elle a été la présidente en 2018, ce qui rendra plus maniable cette œuvre de longue haleine commencée à la fin des années 1950 et achevée en 2018.